Esta unidad tiene sus orígenes en la Guerra contra España, con fecha 1 de marzo de 1866, y se crea con el nombre de "Batallón N° 11° de Línea"; El decreto disponía, se organicen dos compañías para ocupar las plazas de Toltén y Quidico.

Durante el desarrollo de la Guerra del Pacífico y por el alto espíritu combativo del Batallón Cívico Movilizado Caupolicán demostrado en las Batallas de Chorrillos el 13 de enero de 1881, y en Miraflores el 15 de enero de 1881, por disposición del Ministerio de la Guerra, con fecha 27 de octubre de 1881, se organiza el Batallón de Infantería N° 9 de Línea "Caupolicán".

Bajo la presidencia de German Riesco, se crea el Regimiento de Infantería N° 14. "Caupolicán", por DS. N° 719 bis del 15 de marzo de 1906, en la ciudad de Lautaro, fijándose su fecha de aniversario para el 29 de mayo.

En 1908, se traslada a la guarnición de Valdivia, en que permanece por 61 años hasta su llegada a la Isla Grande de Tierra del Fuego.

Con fecha 13 de enero de 2003, por decreto institucional recibe su actual denominación de "Regimiento Reforzado N° 11 "Caupolican", y con fecha 1 de enero de 2008, se le asigna como patronímico al GENERAL DE BRIGADA GUILLERMO ARROYO ALVARADO, en reconocimiento a ser su primer comandante.