Z-curva

Z-curva

Un método Z-curva (o Z curva) es un algoritmo bioinformático para análisis de secuencias de genomas. Una Z-curva es una curva tridimensional que constituye una representación exclusiva (biyectiva) de una secuencia de ADN: para la Z-curva y la secuencia dada de ADN que representa, cada una sólo puede ser reconstruida exclusivamente desde la otra.[1] La curva resultante tiene forma de zig-zag, y de ahí su nombre. Este método ha sido utilizado en diferentes áreas de la investigación genómica, como la identificación de orígenes de replicación,[2] predicción de genes ab initio,[3] identificación isocórica (largas regiones de ADN, mayores de 3 KB, homogéneas en contenido GC),[4] identificación de islas genómicas,[5] y genómica comparativa.[6]

Referencias

  1. ↑ Zhang CT, Zhang R, Ou HY (2003). «The Z curve database: a graphic representation of genome sequences». Bioinformatics 19 (5):  pp. 593-99. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=pubmed&cmd=Retrieve&dopt=AbstractPlus&list_uids=12651717&query_hl=2&itool=pubmed_DocSum. 
  2. ↑ Zhang R, Zhang CT (2005). «Identification of replication origins in archaeal genomes based on the Z-curve method». Archaea 1 (5):  pp. 335-46. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=pubmed&cmd=Retrieve&dopt=AbstractPlus&list_uids=15876567&query_hl=2&itool=pubmed_docsum. 
  3. ↑ Guo FB, Ou HY, Zhang CT (2003). «ZCURVE: a new system for recognizing protein-coding genes in bacterial and archaeal genomes». Nucleic Acids Research 31:  pp. 1780-89. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=pubmed&cmd=Retrieve&dopt=AbstractPlus&list_uids=12626720&query_hl=2&itool=pubmed_DocSum. 
  4. ↑ Zhang CT, Zhang R (2004). «Isochore structures in the mouse genome». Genomics 83 (3):  pp. 384-94. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=pubmed&cmd=Retrieve&dopt=AbstractPlus&list_uids=14962664&query_hl=2&itool=pubmed_docsum. 
  5. ↑ Zhang R, Zhang CT (2004). «A systematic method to identify genomic islands and its applications in analyzing the genomes of Corynebacterium glutamicum and Vibrio vulnificus CMCP6 chromosome I». Bioinformatics 20 (5):  pp. 612-22. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=pubmed&cmd=Retrieve&dopt=AbstractPlus&list_uids=15033867&query_hl=2&itool=pubmed_docsum. 
  6. ↑ Zhang R, Zhang CT (2003). «Identification of genomic islands in the genome of Bacillus cereus by comparative analysis with Bacillus anthracis». Physiological Genomics 16:  pp. 19-23. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=pubmed&cmd=Retrieve&dopt=AbstractPlus&list_uids=14600214&query_hl=2&itool=pubmed_docsum. 

Enlaces externos


Wikimedia foundation. 2010.

Игры ⚽ Поможем написать курсовую

Mira otros diccionarios:

  • Curva de Bézier — Saltar a navegación, búsqueda Construcción de una curva de Bézier. Se denomina curvas de bezier a un sistema que se desarrolló hacia los años 1960, para el trazado de dibujos técnicos, en el diseño aeronáutico y de automóviles. Su denominación es …   Wikipedia Español

  • Curva — (plural: curve) is an Italian term or name for curved stands of seating located at sports stadiums, particularly in Italy; so named, originally, due to their curved or bending shape. The curva plays an integral part in the culture of Ultras and… …   Wikipedia

  • Curva ROC — Saltar a navegación, búsqueda Contenido 1 Curva ROC (Receiver Operating Characteristic) 2 Conceptos Básicos 3 El espacio ROC 4 …   Wikipedia Español

  • Curva de aprendizaje — Saltar a navegación, búsqueda Una curva de aprendizaje describe el grado de éxito obtenido durante el aprendizaje en el transcurso del tiempo. Es un diagrama en que el eje horizontal representa el tiempo transcurrido y el eje vertical el número… …   Wikipedia Español

  • Curva elíptica — Saltar a navegación, búsqueda En matemáticas, las curvas elípticas se definen mediante ecuaciones cúbicas (de tercer grado). Han sido usadas para probar el último teorema de Fermat y se emplean también en criptografía (para más detalles ver el… …   Wikipedia Español

  • Curva de demanda — Saltar a navegación, búsqueda Curvas de demanda y curva de oferta La curva de la demanda es la representación gráfica de la relación matemática entre la máxima cantidad de un determinado bien o servicios que un consumidor estaría dispuesto a… …   Wikipedia Español

  • Curva de Phillips — Saltar a navegación, búsqueda En Macroeconomía, la curva de Phillips representa una curva empírica de pendiente negativa que relaciona la inflación y el desempleo. Introducción La curva de Phillips se introdujo a partir de los datos de la… …   Wikipedia Español

  • Curva de Lorenz — Saltar a navegación, búsqueda Curva de Lorenz La curva de Lorenz es una representación gráfica utilizada frecuentemente para plasmar la distribución relativa de una variable en un dominio determinado. El dominio puede ser el conjunto de hogares o …   Wikipedia Español

  • Curva de Laffer — Saltar a navegación, búsqueda La curva muestra en abcisas los tipos impositivos posibles (t) y muestra en ordenadas la recaudación fiscal (T) que se consigue a ese tipo impositivo La curva de Laffer representa la relación existente entre los… …   Wikipedia Español

  • Curva de longitud constante — Saltar a navegación, búsqueda Una curva de longitud constante o de anchura constante es, en geometría, aquella forma planar convexa cuya longitud o anchura, medida por la distancia entre dos líneas paralelas tangentes a sus dos bordes opuestos,… …   Wikipedia Español

  • Curva de oferta — Saltar a navegación, búsqueda La curva de la oferta es la representación gráfica de la relación matemática entre la máxima cantidad de un determinado bien o servicio que un oferente estaría dispuesto a poner en mercado a cada precio de ese bien.… …   Wikipedia Español

Compartir el artículo y extractos

Link directo
… Do a right-click on the link above
and select “Copy Link”