El tiempo previo a la llegada de los europeos, la actual región de San Theodoros estaba habitada por diversas culturas nativas, como: - Los paztecas: conjunto de pueblos que se unieron y formaron en Imperio pazteca. Fueron muy desarrollados con respecto a sus vecinos enemigos, los arumbayas y los bíbaros. Fueron geniales arquitectos y astrónomos. Construyeron numerosos templos y palacios. Se sustentaban de la agricultura, en la cual aplicaron exitosos métodos de cultivo, y del intercambio comercial, a través de sus excelentes vías de comunicación. Además, cobraban un fuerte tributo a los arumbayas y a los bíbaros a cambio de la paz. - Los bíbaros y los arumbayas: tribus indígenas que estaban muy atrasadas del Imperio pazteca. Sobrevivían gracias a la caza y la recolección de frutos. Vivían en simples chozas y estaban bajo el liderazgo de un cacique.

En marzo de 1533, una expedición española al mando de Herncisco Piztés se adentró en las tierras actuales de San Theodoros. Tuvieron un primer contacto con los bíbaros, quienes recibieron como salvadores a los europeos y les ofrecieron toda clase de obsequios. Continuando la marcha, los españoles se encontraron con los arumbayas, quienes entregaron sus tierras a los conquistadores con alegría. Siguieron la campaña hasta que se encontraron con los paztecas. Estos, a diferencia de los pueblos anteriores, recibieron a los españoles con miedo y hostilidad. A pesar de esto, el confuso Emperador pazteca, Moctehualpa II, recibió a los conquistadores en su capital, la mítica y hermosa ciudad de Tenuzco. A los pocos días, los hombres de Píctez asesinaron al Emperador y saquearon la ciudad. En 1535, Cuathzcan, nieto de Moctehualpa, unió a lo que quedaba del ejército pazteca y empezó una rebelión que terminó con la expulsión de los españoles de Tenuzco. Herncisco Piztés se salvó apenas. En 1536, Piztés una vez obtenido refuerzos de Cuba, se alió militarmente con los bíbaros y los arumbayas y juntos marcharon hacía la Tenuzco. Eran en total unos 1.000 europeos y 25.000 indígenas arumbayas y bíbaros. En Tenuzco, Cuathzcan se salió a enfrentarles en la batalla del Monte Tuma, donde nada pudieron hacer 50.000 hombres contra la poderosa caballería y la incesante artillería española. Fue una masacre total de los paztecas que terminó con la conquista de Tenuzco, que fue arrasada hasta las cenizas. Una vez concluida la conquista, los españoles iniciaron la colonización de las tierras. Cerca de donde estaba situada Tenuzco, fundaron la ciudad de "Nuestra Señora de Las Dópicos" en 1539. La colonización de San Theodoros fue muy pacífica. La colonia exportaba materias primas como yerba mate, chocolate, oro y café. La sociedad nativa se mezcló con la europea, lo que tuvo como consecuencia un gran mestizaje en la población.

La invasión napoleónica a España fue aporivechada por los patriotas santheodoreños para librarse del domino español, que le imponía cada vez más impuestos a las exportaciones y a los negocios. En las Juntas Patrióticas de Abril de 1813, se llamó a la rebelión del pueblo santheodoreño contra el yugo español. El 17 de Julio de 1833, el General criollo José Olivaro lideró la sublevación de los cuarteles de la ciudad de Quemán, tras lo cual lideró al ejército pueblo por pueblo del interior del país hasta conseguir formar un ejército lo suficienyemente fuerte para enfrentar a las fuerzas del gobernador español Juan de Chania. En la batalla de Monte Olindo, el 3 de Diciembre de 1833, 10.000 patriotas santheodoreños liderados por Olivario derrotaron a las 7.000 soldados realistas. Tras la batalla, de Chania entregó la ciudad de Las Dópicos a los patriotas y aceptó la independencia de la República, además de prestar sus servicios a San Theodoros. Pero en enero de 1834, el virrey José Yustia ingresó en territorio santheodoreño al mando de 20.000 soldados, con el fin de acabar con la independencia. El Gral. Olivario salió a recibirlo con 7.000 hombres en la llanura de Visquia. La batalla tuvo lugar el 5 de Febrero de 1834. La batalla parecía perdida para la causa independentista, pero la llegada de 5.000 refuerzos patriotas al mando de propio Juan de Chania alentaron a los independentistas, que al final vencieron a los realistas en esta decisiva batalla. Yustia huyó con pocos hombres de vuelta a su ciudad. San Theodoros era independiente. De Chania fue recibido con todos los honores en Las Dópicos.

Al poco tiempo De Chania y Olivario se conviertieron en cónsules de la República de San Theodoros. El nuevo país prosperaba bajo el gobierno fuerte pero popular de estos dos caudillos. En 1840, Juan de Chania moría por causas naturales. Con esto, la situación económica y social empeoró, y en 1842 los altos terratenientes se rebelaron contra Olivario, quien se vio obligado a exiliarse en Europa. En el Congreso de 1843 se proclamó a Julio Gomia como presidente de la nación. De ahí se intauró una época interminable de rebeliones y derrocamientos, que hacen de San Theodoros uno de los países con más presidentes en la historia.

En 1924, empezaron las disputas entre dos reputados militares del país, el General Alcázar, líder del Partido Nacional de San Theodoros y el General Tapioca, líder del Partido Revolucionario Popular. Así mismo empezaban las disputas territoriales entre San Theodoros y Nuevo Rico por la región del Chapo, a causa de las investigaciones que sostenían haber encontrado petróleo en el Chapo. En 1928, Tapioca alcanzó el poder. Pero a los dos años el Gral. Alcázar, a través de un golpe de Estado lo derroca y prepara al país para una guerra contra Nuevo Rico. La astucia del Coronel Tintín evitaría temporalmente la guerra, pero Alcázar lo mandó arrestar tras recibir mentiras sobre él. El Coronel Tintín, logra huir de la cárcel, pero al huir en un blindado del ejército san theodoreño atraviesa la frontera y causa el detonante de la guerra. La guerra dura meses, pero ninguno de los dos países logra vencer al otro, y al saberse que no había petróleo en el Chapo, Nuevo Rico y San Theodoros llegan a un acuerdo de paz. Terminada la guerra, Tapioca recupera el poder, y en seguida la crisis económica se apodera del país. Tras dos décadas en la oscuridad, Alcázar derroca a Tapioca pero el apoyo del gobierno bordurio a Tapioca hace que este recupete rápidamente el poder. Sin embargo, Alcázar, tras una guerra de guerrillas y un gran y rápido golpe de Estado, expulsa a Tapioca del gobierno, pero decide librarle de la pena de muerte. Poco tiempo después se celebraron las primera elecciones democráticas en el país, que actualmente vive una gran época de prosperidad y desarrollo económico.