Varios símbolos del metro de la ciudad de Nueva York nunca han sido usados, sin embargo algunos símbolos aun continúan en los letreros digitales de algunos trenes. Los símbolos DD, FF y MM son cubiertos por los artículos D, F y M. Los otros están incluidos aquí.

Números IRT

Un vagón R62A en Corona Yard mostrando el símbolo 12.

Un tren del servicio S shuttle en Times Square mostrando de cabeza el símbolo 11.

Los símbolos que actualmente están en algunos trenes son:

• Verde 8, 10 y 12 (el mismo color para el 4, 5 y el 6)
• Purpura 11 (el mismo color para el 7 y su servicio diamante)
• Rojo 13 (el mismo color para el 1, 2 y 3)
• Rojo 9, sin usar desde el 27 de mayo, 2005

Es probable que estos fueron asignados arbitrariamente, para usarse en caso de que se inaugure un nuevo servicio sobre las vías existentes.

Letras IND/BMT

• Las letras P, T, U, X y Y aparecen en algunos letreros como letras negras en un circulo de color blanco. Ningún servicio actualmente usa este color, por lo que se les mandó a parchar por si alguno de estos se convertía en un servicio permanente. El símbolo T esta planeado para la línea de la Segunda Avenida, y será de color turquesa.

• En los 1990s, la P (abreviación de Penn Station) para un servicio directo entre Sutphin Boulevard–JFK (en la estación Jamaica) y la calle 34–Penn Station,continuando localmente hasta la calle 168, vía la línea de la Avenida Archer, línea Jamaica, conexión de la calle Chrystie, línea de la Sexta Avenida y la línea de la Octava Avenida (cambiando luego en West Fourth Street). Esto pudo haberse usado durante una amenaza de huelga contra Amtrak que impediría la entrada de los trenes LIRR a Penn Station.

• Los símbolos I y O debido a la similitud entre los números 1 y 0 respectivamente.

• El símbolo P dejO de usarse a principio de 1960 cuando se empezó a la asignación del uso de letras en los servicios BMT.

• La T fue usada para los servicios de la línea West End, pero fue rápidamente reemplazada por los servicios B después de la reorganización de la calle Chrystie.

• La Y ha sido propuesta como el símbolo de la línea de la Segunda Avenida ,^{[cita requerida]} aunque el nombre propuesto para la línea sigue siendo T.

• El logo del JFK Express, muestra un avión dentro de un circulo azul, fue usado desde 1978–1990, y aun se puede ver en algunos vagones IND .