Anexo:Segunda temporada de Código Lyoko

Jeremy se ha esforzado en encontrar nuevas y mejores maneras para luchar contra XANA. Él desarrolla vehículos nuevos para el grupo y crea un nuevo programa de escáner que detecta inmediatamente torres activadas, permitiendo que Aelita viva en la tierra (Jeremy le regala un móvil rosa para que esté en contacto). El curso comienza una excursión cerca del bosque. Ulrich desea ir con Yumi, pero ella es compañera de William. Él viene de otra escuela, siendo expulsado de ella. Durante la excursión, Jeremy va en busca de su computadora portátil, dejando Aelita en el bosque. Ella es asustada por visiones, que la conducen a una casa conocida como la Ermita. Allí, ella es atacada por XANA. Una vez que los otros llegan para encontrarla, descubren que XANA ha poseído la casa y utiliza todo en él para atacarlos. XANA intenta atraparlos en una sauna y hervirlos, pero tiene éxito solamente en Ulrich y Yumi. Aelita y Odd van a la fábrica para desactivar la torre antes de que sean hervidos vivos. 

Ya que Aelita puede vivir en la tierra, gracias a varios intentos de Jeremy, ella trata de acostumbrarse al nuevo mundo lleno de sorpresas; pero entonces Sissi le gasta una broma muy pesada, por lo cual ella se siente abandonada y decide volver a Lyoko virtualizandose a sí misma, cuando el grupo se entera gracias a la "orgullosa de Sissi" van en busca de ella y se dan cuenta de que se encuentra en peligro y en su intento de huir llega a un límite del sector del bosque y en ese momento una esfera aparece y se la lleva, en ese instante Jeremy recibe una señal débil de un nuevo sector, el sector 5 (llamado Cartago), y gracias a la ayuda de las notas de Franz Hopper logra descifrar un código que lleva a los demás adonde esta Aelita, y ahí se encuentra con la Scyphozoa que intenta robarle la memoria a Aelita, pero sus amigos la salvan, de vuelta en la tierra. El grupo promete no volver a dejar a Aelita sola y a explorar más sobre el nuevo mundo. 

Tras el descubrimiento del sector 5, el grupo decide explorar. Yumi se ve obligada a optar por no continuar después de sus viajes nocturnos a Lyoko que han llamado la atención de sus padres. 

Después de tomar otro viaje al sector 5 y de regresar a la escuela, Aelita y Jeremy conversan acerca de su no ser humano, sin saber que Sissi graba su conversación. Aparte de eso, los datos que habían recuperado del sector 5 eran datos trampa y XANA se hace cargo del superordenador y empieza a activar vueltas al pasado una y otra vez. Jeremy descubre que el regreso al pasado a XANA lo hace más poderoso. Durante la tercera vuelta al pasado XANA, con sus nuevos poderes posee a Sissi y va después a luchar contra Ulrich. No sólo el grupo tienen que hacer frente a Sissi, sino también tiene que parar las vueltas al pasado. 

Como los sueños de Aelita y las alucinaciones se vuelven demasiado perturbadores para ignorar, el grupo va a la Ermita para descubrir su origen. Allí, Aelita encuentra una muñeca que inexplicablemente la reconoce como Mister Pück. Oculto en esta muñeca está el número (167) de un armario de una estación de tren, que contiene el diario de Franz Hopper cifrado. Tras el descubrimiento, XANA toma medidas poseyendo a Jeremy para asegurar que nunca podrá leerlo. 

Es el día de San Valentín y el amor está en el aire. Un hombre poseído por XANA deja un collar en la puerta de la habitación de Aelita, y Aelita está convencida de que se trataba de Jeremy, pero Jeremy no fue. Termina por sospechar de Odd, que evita la cuestión y Jeremy se enfada con él. Esto sitúa a los dos en contra, por así decirlo. Mientras tanto, el collar toma el control de Aelita y se entrega a sí misma a la Scyphozoa. 

La escuela tiene un concierto en el gimnasio para el concurso DJ, y William accidentalmente se le descompone el mezclador, y le pide ayuda a Jeremy. Jeremy está ocupado, por lo que Aelita ofrece su ayuda. Se fija fácilmente el dispositivo, y como lo arregla, William la considera que ella es muy talentosa en el uso del dispositivo, por lo que la hace que haga de DJ. La escuela está celebrando su final, así como Odd, y considera que no está dispuesto en lo más mínimo para aprovar. Entonces, XANA posee a Jim para llevar a Aelita a la Scyphozoa. 

Durante una misión al sector del bosque, Yumi es atacada por la Scyphozoa. Le roba su código genético de ADN, lo que significa que si pierde los puntos se desvirtualizará para siempre. Para empeorar las cosas, harán la foto del día en su clase. Tras un breve debate, Ulrich decide que Sissi se haga pasar por Yumi en la foto. Extrañamente, Sissi está de acuerdo y no pide nada a cambio (que raro, ¿no?). Durante esto, Jeremy trata de encontrar una manera de traer de vuelta a Yumi. Aelita piensa una manera, pero no hablará con Jeremy. Ella sólo se lo dijo una vez que lleguó a Lyoko, por lo que Jeremy no puede oponerse. Ella comienza a transferir su propio código genético a Yumi, que luego descubren que permitirá a XANA tener la memoria de Aelita a su voluntad. 

Ulrich se entera de que Yumi podría tener que volver a Japón porque su padre perdió su trabajo, y él no puede aceptar la pérdida de ella. Después de un equivocado intento de escribir una carta al presidente, escucha los números de la lotería en la radio y le da una idea. Vuelve al pasado, y obtiene un boleto con los números ganadores y se lo da a los padres de Yumi (sin que se entere ella). Cuando los demás se enteran, lo sacan fuera del grupo hasta que puedan averiguar qué hacer. Para empeorar las cosas, XANA activa una torre y posee a Nicolas. Aparte de eso, materializa un ejército de cangrejos en Lyoko. 

Después de descifrar gran parte del diario de Franz Hopper, Jeremy obtiene una idea para hacer un monstruo que lucha del lado del bien: la marabunta. Mediante la combinación de técnicas que hace la marabunta, que es una esfera que se puede reproducir infinitamente y devorar cualquier monstruo que se acerque, a pesar de que funciona bastante bien para empezar, todo va mal cuando la marabunta siente el enlace de Aelita con XANA. Después de los ataques, Odd consigue salvarla. La marabunta amenaza con devorar todo Lyoko. Es derrotada por los guerreros de Lyoko y con los monstruos de XANA, que colaboran juntos. Después los monstruos se van sin causar problemas. 

El uranio del superordenador comienza a fallar, y XANA se ve obligado a poseer a un penal local llamado Peter Duncan para reemplazar el uranio. El superordenador, con las apagadas, no sólo amenaza a XANA, sino también a Aelita, cuyo corazón deja de latir con cada cierre. 

Después de un ataque de XANA, Jeremy insiste en hacer una vuelta al pasado, con independencia del hecho de que XANA ni siquiera cause algún daño. Al ser interrogado, se defiende y se enfada, insistiendo en que es necesario. Luego hay un nuevo interrogatorio sobre la cuestión que vuelve a conducir al mismo resultado. Después de la próxima vuelta al pasado, Jeremy se encuentra inconsciente en su habitación. Tras la decodificación de un vídeo diario que se haya almacenado en su computadora, aprenden que él había estado utilizando las vueltas al pasado para aumentar su propia inteligencia. Cuando está punto de ser llevado al hospital, XANA posee la ambulancia y la conduce hacia el río (con Yumi y Jeremy dentro de la ambulancia). Ahora los otros tienen que guardar a Jeremy y desactivar la torre sin su ayuda. 

Ulrich intenta decirle a Yumi la forma como se siente realmente y la encuentra hablando con William, como se había pensado. Yumi rechaza a William, pero Ulrich se va antes de eso. Mientras tanto, XANA activa una torre y se materializa un cangrejo. En la escuela, se hará una clase de conducción para enseñar a los niños la seguridad vial. William resulta ser un buen conductor y Ulrich no, y William se burla de él. Los dos se pelean y acaban en el despacho del director (luego son llevados a la biblioteca con la compañía de Jim). Jeremy se entera de la torre activada y poco después el grupo se dirige a la fábrica sin Ulrich. Durante este tiempo, el cangrejo va a la casa de Yumi. Cuando el grupo llega a la fábrica, encuentran un segundo cangrejo vigilando la entrada de la fábrica. Yumi se entera del primer cangrejo y va a ayudar a Hiroki mientras Odd distrae al segundo para que puedan llegar al ascensor. En la sala de los escáners, se enteran de que los dos primeros cangrejos destruyeron los escáners, dejando sólo uno utilizable. Aelita va a Lyoko primero. Antes de ir Odd, un tercer cangrejo se materializa, destruyendo el tercer escáner. Ahora Odd tiene que distraer a este cangrejo, y Ulrich y William tienen que distraer al segundo, y Yumi y su familia tienen que distraer al primero. No sólo eso, sino Aelita tiene que hacer su camino a la torre sin ningún tipo de apoyo. William y Ulrich destruyen el cangrejo que está en Kadic y William va a ayudar a Odd mientras Ulrich va a ayudar a Yumi. 

XANA posee a Kiwi para que muerda a alguien para le infectarle un virus que convierte a los infectados en zombies. Para empeorar las cosas, Aelita y Jeremy están atrapados en la cafetería por lo tanto no tienen acceso a la fábrica y Odd es infectado por Kiwi. 

XANA posee al director y secuestra a Odd y Yumi, y le da un ultimátum a Jeremy: entregar a Aelita a la Scyphozoa o el sacrificio de sus amigos. 

Después de un mal funcionamiento con el programa de materialización, Odd acaba en el cuerpo de Yumi y Yumi en el de Odd. Y lo que es peor, sus átomos comienzan a separarse después de un tiempo. El grupo tiene que ir a Lyoko y solucionar el problema antes de que Odd y Yumi desaparezcan para siempre, pero no es fácil cuando XANA intenta detenerlos. 

XANA se transforma en un clon de Jeremy y besa a la actual novia de Odd, este se enfada con el al igual que Aelita que se ha sentido traicionada. Después se convierte en un clon de Yumi y besa a Mathias Burel haciendo que Ulrich se enfade con ella. Más tarde se transforma en un clon de Ulrich y besa a Sissi mientras Yumi lo ve todo y después se transforma en Aelita y besa a Nicolas. Al final XANA consigue que todos se enfaden unos con otros pero Jeremy descubre que todo ha sido cosa del clon creado por XANA y Jeremy va corriendo a la Ermita para encontrar a Aelita que al enfadarse se había refugiado allí, pero el clon de Jeremy llega antes y… la besa! Aelita reconoce que ese no es el verdadero porque Jeremy nunca le hubiera besado. En ese momento llegan todos, Odd se queda para encargarse de que el clon no cause más problemas y el resto se van a Lyoko para desactivar la torre. Aelita desactiva la torre y una vez a salvo empiezan a hablar sobre lo ocurrido. Entonces Aelita le dice a Jeremy que venga un momento que tiene que "comprobar" una cosa y… le besa! El primer beso de Jeremy y Aelita! Jeremy queda paralizado casi sin poderse mover y todos acaban riéndose. 

Después de un viaje al sector 5, Jeremy cree que tiene los datos necesarios para curar a Aelita del virus. Aunque los dos trabajos sobre la cura, Odd, Ulrich y Yumi tienen que ir a un concurso de escalada en roca. A Ulrich le da vértigo y tiene miedo las caídas. Yumi se da cuenta de que él tiene vértigo. Ulrich, avergonzado, se va fuera. Por su parte, Jeremy encuentra el anti-virus y se lo entrega a Aelita. A pesar de algunos problemas con la aplicación, resulta bien. Sin embargo, esto no dura. Un error en el anti-virus le causa a su vez invisible. Aparte de eso, ella no puede entrar en las torres en Lyoko, lo que hace imposible para ella parar el ataque de XANA. Mientras, uno lobos poseídos por XANA atacan a Odd, Ulrich y Yumi. 

Un famoso reportero llamado Vincent Thomas visitas a la escuela para hacer un reportaje sobre el rendimiento de las escuelas de hoy. Mientras tanto, XANA comienza a mostrar alguna extraña conducta, la de activar las torres y, a continuación, antes de que el grupo puede llegar a ellas, desactivarlas. Confundidos, Aelita y Jeremy van a la fábrica para investigar, mientras que los otros se van. Es sólo después que XANA pasa a la acción: activa una torre y causa una enorme tormenta de nieve. Yumi queda atrapada y Ulrich se queda a ayudarla, mientras Odd llega a la fábrica. Jeremy se ve obligado a enviar a Aelita sola a Lyoko. 

La visiones de Aelita se convierten en un problema una vez más, pero no la misma visión como antes. Esta vez, ella tiene visiones de ella y Franz Hopper siendo perseguidos por agentes del Gobierno. Acaba teniendo visiones incluso cuando está despierta, provocando que pierda la conciencia mientras que está en la piscina y cae al agua. Al querer saber cuál es la fuente de las visiones, se dirige a la Ermita para aprender más acerca de ellos. Jeremy descubre que XANA está causando las visiones a través de su vínculo con el superordenador. Durante la misión de acabar con ellas, Aelita va al sector 5, decidido a descubrir la fuente de las visiones. 

Durante la clase de física, XANA posee la enfermera de la escuela, Yolanda, y secuestra a Aelita. El resto del grupo va a la fábrica, pero no hay manera de recuperar a Aelita de la mucho más poderosa enfermera. Como no tienen otra opción, Jeremy decide probar un experimento que dará a una persona las mismas facultades que posee una de XANA. Para hacer esto, tiene que activar una torre como XANA. Jeremy activa una torre de color verde en lugar de rojo. Odd se ofrece como voluntario, y se ve reforzado por un espectro como el de XANA creado por Jeremy. Esto permite a Odd para luchar contra la enfermera de manera efectiva, mientras que los otros van a desactivar la torre. Esta fortuna no dura, sin embargo. XANA es capaz de hacerse cargo de la torre de Jeremy, revirtiendo el efecto del espectro para quitar la energía a Odd. Ahora el grupo tiene que desactivar no sólo la torre original, sino también la otra. 

Después de leer acerca de un hombre muerto llamado Lion Corbe, que murió durante la construcción de Kadic, Sissi intenta comunicarse con él. Ella consigue convencer a asistir a Ulrich. Durante la comunicación, uno de los fantasmas de XANA aparece en forma del fantasma de Lion. En primer lugar, parece dócil, pero pronto se enfada y los ataca. Ulrich habla con Sissi mientras Odd se lo va a decir a Jeremy. Jeremy no puede encontrar una torre activada, lo que le parece mal teniendo en cuenta la situación. Como Jim patrulla los pasillos, él es recogido por un objeto invisible. Con el fantasma, el grupo de Lyoko va a la fábrica. Después de su llegada, Aelita, Odd y Yumi van a Lyoko. Odd busca la torre mientras que las chicas van al sector 5 para arreglar el escáner. Jeremy y Ulrich luchan contra el fantasma. 

Cuando van a la fábrica se encuentran a Franz Hopper. Él les da más energía en Lyoko. Pero Jeremy descubre que en realidad es XANA, y les quitan las armas a los guerreros de Lyoko, y no pueden desvirtualizarse, y virtualiza a Aelita sola en el sector del desierto para que la Scyphozoa le robe toda la memoria, pero Aelita es un señuelo y gracias a la ayuda de Aelita de verdad y Jeremy el fantasma de XANA se va, pero vuelve para ahogar a Jeremy. Aquí descubren que hay una torre en el sector 5 (que está activada), luchan en Lyoko y acaban desactivando la torre, la única torre en el sector 5, y todos vuelven al mundo real. 

Durante un cortometraje realizado por Odd y protagonizada por Sissi, ella parece ser poseída por un fantasma. Ella no actúa como se esperaba, sin embargo. Por el contrario, ella comienza a hablar en alguna extraña lengua, centrándose en Jeremy, como lo hace. Ella es llevada a la enfermería como consecuencia de ello. Más tarde, ella camina a la habitación de Jeremy y escribe algo de código en un pedazo de papel. Jeremy traduce el código, mostrando un mensaje indicando un deseo de ayudar. Sissi es enviada al hospital después de esto, obligando a Odd y Yumi a ir allí y recogerla. En un viaje a Lyoko, Aelita y Ulrich descubre una torre blanca. XANA no es feliz sobre la torre, y envía megatanques. Al mismo tiempo, se activa una torre y posee una enfermera en el hospital a hacer lo mismo a Sissi. Odd y Yumi son capaces de impedir a la enfermera de hacerlo. Llevan Sissi a la fábrica para terminar el mensaje que ella inició un poco antes. Después de desactivar la torre, Jeremy se traduce el mensaje, revelando que Franz Hopper había activado la torre blanca. 

Está llegando al final del año y la investigación de Jeremy le ha llevado a un callejón sin salida. Después de que el grupo recoge algunos datos del sector 5, tiene previsto activar una torre para descifrar el diario de Franz Hopper. Antes de la misión, Odd recibe un mensaje de una niña de misterio. Cuando él va a cumplir con ella, él es atacado por uno de los fantasmas de XANA y encerrado dentro de un pozo en la Ermita. Entonces el fantasma asume la forma de Odd y va a Lyoko en su lugar. Poco después de comenzar, el fantasma se convierte en el grupo, devirtualiza Yumi y a Ulrich lo expulsa fuera de la torre con tres tarántulas para protegerlo. Al mismo tiempo, XANA intenta apoderarse de la torre de Jeremy y bloquear la el procedimiento de decodificación. Jeremy se da cuenta de que es un fantasma durante la lucha, y Yumi va a encontrar el verdadero Odd. Después de que el fantasma resulta ser ineficaz contra Ulrich, se convierte en un clon de Ulrich. De esta forma, se demuestra ser un partido igual para él. Después de mucha lucha, finalmente Ulrich vence el clon, pero es combatido un poco después por una tarántula. Justo cuando parece apoderarse XANA de la torre que ha activado Jeremy, Franz Hopper la protege. El diario luego se decodifica totalmente. Después de examinar el diario, Jeremy le dice a Aelita que ella es hija de Franz Hopper. 

Después de ver el diario de Franz Hopper, Jeremy descubre la verdad sobre el superordenador, al menos en cierta medida. Hopper había utilizado muy ampliamente, hasta el punto de repetir un solo día durante más de siete años. Hopper también reveló que él y Aelita reúnen las claves de Lyoko, que fue después de XANA. Él sólo necesita su medio, ahora. Aelita trató de apagar el ordernador pero Jeremy lo activa de nuevo y salva a Aelita. Jeremy también encuentra un modo de liberar a Aelita del superordenador. Resulta que Aelita nunca tuvo un virus. De hecho, XANA le quitó un pedazo de ella, que se encarga de vincularla al superordenador. Aelita no está dispuesta a ir, enojada por el hecho de que Hopper había tomado esencialmente su vida de ella. Ella se preocupa también de que XANA podría escapar. Con ese fin, ella apaga el superordenador. Jeremy la rescata, y el grupo va a Lyoko para recuperar su fragmento. Después de todo sus esfuerzos, parecen tener éxito, pero resulta ser falso. XANA consigue robar su memoria, su muerte de manera efectiva y que le permite escapar, y apaga Lyoko en el proceso. Su escape permite a Franz Hopper reactivar Lyoko y Aelita, y restablecer toda la memoria de Aelita. A través de la restauración, Aelita finalmente recuerda su pasado hasta el punto que fue a Lyoko. Con XANA ahora libre y Aelita con la memoria recuperada, no están vinculados al superordenador. Esto significa que puede apagarlo, pero no vencería a XANA. Inseguro de cómo se va a proceder, Jeremy promete que encontrará una manera de vencer a XANA.