Transcriptoma

Introducción y definición

Desde la caracterización del genoma humano, han surgido nuevas vías de investigación sobre el análisis global del material genético. Es evidente que no todo el genoma es transcrito y traducido finalmente a proteínas, lo que ha dado lugar a conceptos discutibles como el de DNA basura, que en realidad únicamente se caracteriza por el desconocimiento científico de muchas de sus funciones.

Así pues, un reto consiste en estudiar qué porción del genoma es transcrito a RNA mensajero: es decir, qué material genético es expresado en un tipo celular bajo unas condiciones dadas. Así pues, el concepto de transcriptoma surge para representar todo este mRNA transcrito bajo unas circunstancias, de forma global. Cabe destacar que, mientras que se habla del genoma humano, este epíteto no tiene sentido para el transcriptoma humano, puesto que hay infinidad de transcriptomas dependiendo del tipo tisular o las condiciones ambientales aun para la misma especie.

Técnicas empleadas en su análisis

La transcriptómica permite cuantificar el nivel de expresión de genes, empleando técnicas que permiten analizar miles de moléculas de mRNA al mismo tiempo, mediante una técnica basada en micromatrices.

Chip de DNA, empleado para detectar expresión de genes de humano, a la izquierda, y de ratón, a la derecha.

Otras Ómicas

Cabe destacar que el transcriptoma no da idea exacta del nivel de expresión de un conjunto de proteínas: para ello, su análisis global, se analiza el proteoma. Así mismo, existen otros análisis globales centrados en aspectos muy específicos de la biología de proteínas: por ejemplo, la metabolómica, la fenómica, la interactómica...