N-terminal

El extremo N-terminal (también conocido como amino-terminal, NH₂-terminal, extremo amina) se refiere al extremo de una proteína o polipéptido que finaliza con un aminoácido que posee un grupo amina libre. La convención que existe al escribir péptidos indica que el extremo N-terminal va a la izquierda y la secuencia proteica va desde el N-terminal al C-terminal o carboxilo terminal

Química

Cada aminoácido posee un grupo carboxilo y un grupo amino, los cuales se unen entre sí formando una cadena mediante una reacción de deshidratación (pierden 1 molécula de agua) entre un Hidrógeno del grupo amino de un aminoácido y el hidroxilo presente en el grupo carboxilo del otro aminoácido. De ésta manera, las cadenas polipeptídicas poseen un extremo con un grupo carboxilo libre, o sin reaccionar, mientras que el otro extremo posee un grupo amino libre, el N-terminal.

Cuando la proteína es traducida desde el ARN mensajero, ésta es creada desde el extremo N-terminal al C-terminal. El extremo amino de un aminoácido (en un tRNAcargado), durante la fase de elongación en la traducción, ataca el extremo carboxilo de la cadena polipeptidica que se esta formando. Puesto que el codon de inicio del código genético codifica el aminoácido Metionina, la mayoría de las secuencias protéicas comienzan con una metionina (específicamente con la versión modificada N-formilmetionina, fMet). Sin embargo, algunas proteínas son modificadas post-traduccionalmente, por ejemplo, cortando una proteína precursora, y es por esto que pueden existir diversos aminoácidos en el extremo N-terminal

Funciones

Señalización

El extremo N-terminal es la primera parte de una proteína que sale del ribosoma durante la síntesis proteica. Contiene, generalmente, secuencias que actúan como señales de destino intracelular, básicamente como un código postal, que permite que la proteína sea entregada al lugar designado dentro de la célula. Ésta señal de destino usualmente es cortada luego de una exitosa destinación, por una peptidasa. Además, el ácido N amino terminal de una proteína es un factor importante que gobierna su vida media (probabilidad de ser degradados). Esto se conoce como la regla del N-terminal.

• Péptido Señal

El péptido señal del extremo N-terminal es reconocido por la partícula de reconocimiento de la señal (SRP, por Signal Recognition Particle) lo que da como resultado la destinación de la proteína a una vía de secreción. En la célula eucariota, éstas proteínas son sintetizadas en el Retículo endoplásmático rugoso. En células procariotas, las proteínas son exportadas a través de la membrana plasmática. En los cloroplastos, el péptido señal destina las proteínas a los tilacoides.

• Péptido de destinación mitocondrial

El Péptido de destinación mitocondrial (mtTP, por sus siglas en Inglés MiTochondrial Targeting Peptide) en el extremo N-terminal, permite que la proteína sea importada al interior de la mitocondria

• Péptido de destinación al cloroplasto

El Péptido de destinación al cloroplasto (cpTP, por sus siglas en Inglés ChloroPlast Targeting Peptide) en el extremo N-terminal, permite que la proteína sea importada al interior del cloroplasto.

Modificaciones N-terminal

Algunas proteínas son modificadas post-translationalmente por la adición de membranas de sujeción que permite a la proteína asociarse con la membrana sin tener un dominio transmembránico. El N-terminal (así como el C-terminal) de una proteína se puede modificar de esta manera.

• N-Miristoilación

El N-terminal se puede modificar por la adición de una sujeción miristóilica. Las proteínas que son modificadas de esta forma contienen un patró común en su N-terminal como una señal de modificación.

• N-Acilación

El N-terminal también se puede modificar por la adición de un ácido graso de sujeción para formar proteínas N-aciladas. La forma más común de tal modificación es la adición de un grupo palmitoílico.

Véase también

• C-terminal