Jmol

Jmol
Jmol
Logo de Jmol
Jmol screenshot streptavidin.png
Jmol es un visor de Java moleculares para estructuras químicas en 3D
Desarrollador
equipo de desarrollo de Jmol
www.jmol.org y wiki.jmol.org
Información general
Última versión estable 12.0.28
19 de enero de 2011; hace 9 meses (2011-01-19)
Última versión en pruebas 12.1.31
19 de enero de 2011; hace 9 meses (2011-01-19)
Género Modelización molecular
Programado en Java
Sistema operativo multiplataforma
Licencia GPL
Idiomas catalán, chino, checo, danés, holandés, inglés, francés, alemán, húngaro, indonesio, italiano, coreano, portugués, español, turco, ucraniano[1]
En español Sí. 

Jmol es un visor open source de estructuras químicas 3D.[2] Jmol devuelve una representación en 3D de una molécula que puede ser usada como herramienta de enseñanza,[3] o para la investigación por ejemplo, en química y bioquímica. Es software libre y de código abierto, escrito en Java y por lo que se puede ejecutar en Windows, Mac OS X, Linux y sistemas Unix. Existe una aplicación independiente y un kit de herramientas de desarrollo que puede ser integrado en otras aplicaciones Java. La característica más notable es un applet que se puede integrar en páginas web para mostrar las moléculas de muchas formas. Por ejemplo, las moléculas se pueden mostrar como modelos de "bola y palo", modelos "que llenan el espacio", modelos de "cinta", etc.[4] Jmol es compatible con una amplia gama de formatos de archivo moleculares, incluyendo Protein Data Bank (AP), archivo de información cristalográfico (CIF), MDL Molfile (mol), y Chemical Markup Language (LMC).

La miniaplicación Jmol, entre otras capacidades, ofrece una alternativa al plug-in Chime, que ya no está bajo desarrollo activo. Aunque Jmol tiene muchas características que no están disponibles en Chime, no pretende reproducir toda la funcionalidad de Chime (en particular, el modo de Sculpt o esculpir). Chime requiere instalar un plug-in e Internet Explorer 6.0 o Firefox 2.0 de Microsoft Windows, u OS 9/Netscape Communicator 4.8 en Macintosh. Jmol requiere instalar Java y funciona en una amplia variedad de plataformas. Por ejemplo, Jmol es completamente funcional en Mozilla Firefox, Internet Explorer, Opera y Google Chrome de Microsoft Windows, en Mozilla Firefox de Linux y en Safari de Mac OS X.


Imágenes

  • Estructura cristalina de un H/ACA box RNP de Pyrococcus furiosus

  • Dos puentes de sal en el tetrámero de hemoglobina (grupo hemo mostrado como barras en la parte inferior derecha).

  • Un fragmento del factor de transcripción TFIIIA formando tres motivos consecutivos con dedos de zinc, con destino a un segmento de ADN.

  • Ribosoma eubactearial 70S de Thermus thermophilus.

Notas

  1. ↑ Jmol translations
  2. ↑ Chen, Jim X. (2008), Springer, ed., Guide to Graphics Software Tools, p. 471, ISBN 978-1-84800-900-4, http://books.google.com/?id=Rv2gncprg3gC&pg=PA471&dq=jmol+is+3d#v=onepage&q=jmol%20is%203d&f=false 
  3. ↑ Herraez, A (2006), «Biomolecules in the Computer: Jmol to the Rescue», Biochemistry and Molecular Biology Education 34 (4): 7, doi:10.1002/bmb.2006.494034042644, http://eric.ed.gov/ERICWebPortal/recordDetail?accno=EJ759053 
  4. ↑ Herraez, A (2007), Lulu, ed., How to Use Jmol to Study and Present Molecular Structures, Volume 1, p. 21, ISBN 978-1-84799-259-8, http://books.google.com/?id=59kQFyfbsJMC&pg=PA21&dq=jmol+applet+web#v=onepage&q=jmol%20applet%20web&f=false 

Véase también

Enlaces Internos

Enlaces externos


Wikimedia foundation. 2010.

Игры ⚽ Нужен реферат?

Mira otros diccionarios:

  • Jmol — Entwickler Jmol Development Team Aktuelle Version 12.01 (30. Juli 2010) Betriebssystem Plattformübergreifend Kategorie Molekulardesign Lizenz …   Deutsch Wikipedia

  • Jmol — Molécule de Streptavidine …   Wikipédia en Français

  • Jmol — Jmol …   Википедия

  • Jmol — Infobox Software name = Jmol caption = Jmol is a Java molecular viewer for three dimensional chemical structures. developer = Jmol development team released = ? frequently updated = yes programming language = Java operating system = Cross… …   Wikipedia

  • Renewed JMOL — Renewed judgment as a matter of law (JMOL) is the partner of judgment as a matter of law in American federal courts. Renewed judgment as a matter of law has replaced judgment notwithstanding the verdict (JNOV) through Rule 50 of the Federal Rules …   Wikipedia

  • Judgment as a matter of law — (JMOL) is a motion made by a party, during trial, claiming the opposing party has insufficient evidence to reasonably support its case. JMOL is similar to summary judgment, which is a motion made before trial. JMOL is also known as a directed… …   Wikipedia

  • Molecular graphics — (MG) is the discipline and philosophy of studying molecules and their properties through graphical representation.[1] IUPAC limits the definition to representations on a graphical display device .[2] Ever since Dalton s atoms and Kekulé s benzene …   Wikipedia

  • Protein Data Bank — The Protein Data Bank (PDB) is a repository for 3 D structural data of proteins and nucleic acids. These data, typically obtained by X ray crystallography or NMR spectroscopy and submitted by biologists and biochemists from around the world, are… …   Wikipedia

  • MDL Chime — is a free plugin used by web browsers to display the three dimensional structures of molecules. It is part of the ISIS product line acquired by Symyx Technologies from scientific publisher Elsevier in October 2007. It is based on the RasMol code …   Wikipedia

  • Judgment notwithstanding verdict — Civil procedure in the United States Federal Rules of Civil Procedure Doctrines of civil procedure Jurisdiction Subject matter jurisdiction Diversity jurisdiction Personal jurisdiction Removal jurisdiction Venue Change of venue …   Wikipedia

Compartir el artículo y extractos

Link directo
… Do a right-click on the link above
and select “Copy Link”