En Chile, habitualmente las comunas son denominadas con el nombre de la ciudad donde reside la Municipalidad. Sin embargo, existen algunas comunas que tienen un nombre distinto al de su cabecera. La siguiente es una lista de las comunas chilenas cuyo nombre es distinto del de su capital.

• XV Región de Arica y Parinacota
  • Provincia de Arica
    • Camarones, cuya capital es Cuya.
  • Provincia de Parinacota
    • General Lagos, cuya capital es Visviri.

• II Región de Antofagasta
  • Provincia de Antofagasta
    • Sierra Gorda, cuya capital es Baquedano.

• IV Región de Coquimbo
  • Provincia de Limarí
    • Río Hurtado, cuya capital es Samo Alto.
  • Provincia de Choapa
    • Canela, cuya capital es Canela Baja (anteriormente, la comuna recibió el nombre de Mincha).

• V Región de Valparaíso
  • Provincia de Isla de Pascua
    • Isla de Pascua, cuya capital es Hanga Roa.
  • Provincia de Valparaíso
    • Juan Fernández, cuya capital es San Juan Bautista.

• VI Región del Libertador General Bernardo O'Higgins
  • Provincia de Cachapoal
    • Olivar, cuya capital es Olivar Alto.
    • Mostazal, cuya capital es San Francisco de Mostazal.

• VII Región del Maule
  • Provincia de Talca
    • Río Claro, cuya capital es Cumpeo.
  • Provincia de Cauquenes
    • Pelluhue, cuya capital es Curanipe.

• VIII Región del Biobío
  • Provincia de Ñuble
    • Ñiquén, cuya capital es San Gregorio.
    • Ránquil, cuya capital es Ñipas.
  • Provincia de Biobío
    • Alto Biobío, cuya capital es Ralco.
    • Tucapel, cuya capital es Huépil.

• IX Región de la Araucanía
  • Provincia de Cautín
    • Saavedra, cuya capital es Puerto Saavedra.
    • Toltén, cuya capital es Nueva Toltén.

• XIV Región de los Ríos
  • Provincia de Valdivia
    • Mariquina, cuya capital es San José de la Mariquina.

• X Región de Los Lagos
  • Provincia de Osorno
    • San Juan de la Costa, cuya capital es Puaucho.
    • Puyehue, cuya capital es Entre Lagos.
  • Provincia de Chiloé
    • Quinchao, cuya capital es Achao.
  • Provincia de Palena
    • Hualaihué, cuya capital es Hornopirén.

• XI Región Aisén del General Carlos Ibáñez del Campo
  • Provincia de Aisén
    • Aisén, cuya capital es Puerto Aisén.
    • Cisnes, cuya capital es Puerto Cisnes.
    • Guaitecas, cuya capital es Melinka.
  • Provincia de Coihaique
    • Lago Verde, cuya capital es La Tapera.
  • Provincia de General Carrera
    • Río Ibáñez, cuya capital es Puerto Ingeniero Ibáñez.
  • Provincia de Capitán Prat
    • O'Higgins, cuya capital es Villa O'Higgins.
    • Tortel, cuya capital es Caleta Tortel.

• XII Región de Magallanes y de la Antártica Chilena
  • Provincia de Última Esperanza
    • Natales, cuya capital es Puerto Natales.
    • Torres del Paine, cuya capital es Cerro Castillo.
  • Provincia de Magallanes
    • Laguna Blanca, cuya capital es Villa Tehuelches.
    • San Gregorio, cuya capital es Punta Delgada.
  • Provincia de Tierra del Fuego
    • Primavera, cuya capital es Cerro Sombrero.
    • Timaukel, cuya capital es Camerón.
  • Provincia de la Antártica Chilena
    • Cabo de Hornos, cuya capital es Puerto Williams (anteriormente la comuna recibió el nombre de Navarino).
    • Antártica, cuya capital es Puerto Covadonga.

Las regiones de Tarapacá y Metropolitana no tienen comunas heterónomas.